Die Franche-Comté («Freigrafschaft»), entlang der Jurakette auf vielen Kilometern an die Schweiz angrenzend, war eine der historischen Provinzen von Frankreich. 1790 wurde sie aufgeteilt in die Départements Doubs, Jura und Haute-Saône. Bei der Schaffung der Verwaltungszone Franche-Compté im Jahr 1960 wurde ihr auch das Territoire de Belfort zugeordnet, das früher zum Elsass gehörte. Verwaltungssitz der Region ist Besançon.