Proteus Airlines wurde 1985 gegründet und fliegt seit 1997 grösstensteils als Franchise-Nehmerin im Auftrag der Air France. Im Oktober 1999 wird sie noch Flandre Air übernehmen, aber unter deren Name weiterführen. Ende 2001 werden Proteus Airlines und Flandre Air in der Régional (Régional Compagnie Aérienne Européenne) aufgehen, die sich mittlerweile auch im Besitz von Air France befindet.